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差異基因分析


結(jié)果:

image.png



結(jié)果解讀:

圖中是使用limma包進(jìn)行差異基因分析后的部分結(jié)果,其中logFC,adj.P.Val,P.value是比較重要的參數(shù)。

logFC代表基因兩組樣本中相對(duì)的變化趨勢(shì),一般認(rèn)為image.png有意義,可根據(jù)具體數(shù)據(jù)分析情況選值;

adj.P.Val 是調(diào)整后的P值,一般認(rèn)為adj.P.Val < 0.01 有意義,可以根據(jù)具體數(shù)據(jù)分析情況調(diào)整選值;

P.value代表差異顯著性,一般認(rèn)為P.value<0.05代表顯著差異,可以根據(jù)具體數(shù)據(jù)分析情況調(diào)整選值;



差異基因分析

通過不同的差異基因分析方法,找到在兩組不同樣本中表達(dá)有顯著差異的基因。


分析要求

基因表達(dá)數(shù)據(jù),以及樣本分組情況。


提供結(jié)果:

根據(jù)需要篩選出不同樣本間差異表達(dá)的基因。






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